Source | Name of subclone | Laboratory name of subclone | Left end sequence | Accession number | Number of nucleotides sequenced (left end) | Right end sequence | Accession number | Number of nucleotides sequenced (right end) | Additional sequence reads | Number of nucleotides (additional reads) | Number of overlapping nucleotides (additional reads) | Total number of nucleotides of subclone sequenced | Number of single variants | Number of common variants | Common and abundant variants | Frequency of single variants (%) | Number of single variants (within 365 bp overlap) | Frequency of single variants (within 365 bp overlap) (%) |
A6 | A6BamHI-1 | A6_2_4 | T7 | AJ509874 | 535 | T3 | AJ509938 | 534 | 1069 | 28 | 13 | 9 | 0.33 | 13 | 0.445 | |||
A6BamHI-2 | A6_2_10 | T3 | AJ509875 | 535 | T7 | AJ509939 | 534 | 1069 | ||||||||||
A6BamHI-3 | A6_2_12 | T3 | AJ509876 | 535 | T7 | AJ509940 | 534 | 1069 | ||||||||||
A6BamHI-4 | A6_2_13 | T3 | AJ509877 | 535 | T7 | AJ509941 | 534 | X-4A | 377 | 342 | 1069 | |||||||
A6BamHI-5 | A6_2_17 | T3 | AJ509878 | 535 | T7 | AJ509942 | 534 | X-4A | 377 | 342 | 1069 | |||||||
A6BamHI-6 | A6_2_18 | T3 | AJ509879 | 535 | T7 | AJ509943 | 534 | X-4A | 377 | 342 | 1069 | |||||||
A6BamHI-7 | A6_2_22 | T3 | AJ509880 | 535 | T7 | AJ509944 | 534 | X-3A | 394 | 359 | 1069 | |||||||
A6BamHI-8 | A6_2_24 | T7 | AJ509881 | 477 | T3 | AJ509945 | 534 | X-4A | 377 | 342 | 1011 | |||||||
Sum: | 8494 | |||||||||||||||||
A7 | A7BamHI-1 | A7_4 | T3 | AJ509882 | 535 | T7 | AJ509946 | 534 | X-3A | 369 | 293 | 1069 | 13 | 13 | 10 | 0.137 | 3 | 0.09 |
A7BamHI-2 | A7_14 | T3 | AJ509883 | 535 | T7 | AJ509947 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7BamHI-3 | A7_17 | T3 | AJ509884 | 535 | T7 | AJ509948 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7BamHI-4 | A7_1 | T7 | AJ509885 | 400 | T3 | AJ509949 | 534 | 934 | ||||||||||
A7BamHI-5 | A7_5 | T7 | AJ509886 | 535 | T3 | AJ509950 | 534 | X-3A | 269 | 22 | 1069 | |||||||
A7BamHI-6 | A7_6 | T7 | AJ509887 | 535 | T3 | AJ509951 | 534 | X-3A | 231 | 99 | 1069 | |||||||
A7BamHI-7 | A7_8 | T7 | AJ509888 | 532 | T3 | AJ509952 | 534 | X-4A | 377 | 190 | 1066 | |||||||
A7BamHI-8 | A7_15 | T3 | AJ509889 | 535 | T7 | AJ509953 | 534 | X-4A | 377 | 342 | 1069 | |||||||
A7BamHI-9 | A7_16 | T7 | AJ509890 | 532 | T3 | AJ509954 | 534 | 1066 | ||||||||||
Sum: | 9480 | |||||||||||||||||
A8 | A8BamHI-1 | A8_2 | T7 | AJ509903 | 535 | T3 | AJ509967 | 534 | X-3A | 355 | 285 | 1069 | 8 | 13 | 12 | 0.083 | 1 | 0.03 |
A8BamHI-2 | A8_3 | T7 | AJ509904 | 535 | T3 | AJ509968 | 534 | X-3A | 464 | 383 | 1069 | |||||||
A8BamHI-3 | A8_4 | T7 | AJ509905 | 535 | T3 | AJ509969 | 534 | 1069 | ||||||||||
A8BamHI-4 | A8_6 | T3 | AJ509906 | 535 | T7 | AJ509970 | 534 | 1069 | ||||||||||
A8BamHI-5 | A8_7 | T7 | AJ509907 | 535 | T3 | AJ509971 | 534 | 1069 | ||||||||||
A8BamHI-6 | A8_8 | T3 | AJ509908 | 535 | T7 | AJ509972 | 534 | 1069 | ||||||||||
A8BamHI-7 | A8_10 | T7 | AJ509909 | 535 | T3 | AJ509973 | 534 | 1069 | ||||||||||
A8BamHI-8 | A8_13 | T7 | AJ509910 | 535 | T3 | AJ509974 | 534 | 1069 | ||||||||||
A8BamHI-9 | A8_14 | T7 | AJ509911 | 532 | T3 | AJ509975 | 534 | 1066 | ||||||||||
Sum: | 9618 | |||||||||||||||||
A10 | A10BamHI-1 | A10_2 | T3 | AJ509912 | 535 | T7 | AJ509976 | 534 | 1069 | 7 | 18 | 13 | 0.065 | 3 | 0.082 | |||
A10BamHI-2 | A10_3 | T7 | AJ509913 | 532 | T3 | AJ509977 | 534 | 1066 | ||||||||||
A10BamHI-3 | A10_4 | T7 | AJ509914 | 532 | T3 | AJ509978 | 534 | 1066 | ||||||||||
A10BamHI-4 | A10_5 | T7 | AJ509915 | 532 | T3 | AJ509979 | 534 | 1066 | ||||||||||
A10BamHI-5 | A10_11 | T7 | AJ509916 | 535 | T3a | AJ509980 | 534 | T3 | 465 | 465 | 1069 | |||||||
A10BamHI-6 | A10_12 | T7 | AJ509917 | 535 | T3 | AJ509981 | 534 | X-3A | 328 | 196 | 1069 | |||||||
A10BamHI-7 | A10_8 | T3 | AJ509918 | 535 | T7 | AJ509982 | 534 | 1069 | ||||||||||
A10BamHI-8 | A10_9 | T7 | AJ509919 | 535 | T3 | AJ509983 | 534 | 1069 | ||||||||||
A10BamHI-9 | A10_10 | T3 | AJ509920 | 535 | T7 | AJ509984 | 534 | 1069 | ||||||||||
A10BamHI-10 | A10_1 | T7 | AJ509921 | 535 | T3 | AJ509985 | 534 | 1069 | ||||||||||
Sum: | 10681 | |||||||||||||||||
B11 | B11BamHI-1 | B11_2_4 | T7 | AJ509922 | 535 | T3a | AJ509986 | 534 | T3 | 298 | 298 | 1069 | 21 | 26 | 9 | 0.197 | 9 | 0.247 |
B11BamHI-2 | B11_3_1 | T7 | AJ509923 | 535 | T3 | AJ509987 | 534 | 1069 | ||||||||||
B11BamHI-3 | B11_3_2 | T7 | AJ509929 | 535 | T3 | AJ509993 | 534 | 1069 | ||||||||||
B11BamHI-4 | B11_3_4 | T3 | AJ509924 | 535 | T7 | AJ509988 | 534 | 1069 | ||||||||||
B11BamHI-5 | B11_3_5 | T3 | AJ509925 | 509 | T7 | AJ509989 | 534 | 1043 | ||||||||||
B11BamHI-6 | B11_3_7 | T3a | AJ509930 | 535 | T7 | AJ509994 | 534 | T3 | 344 | 344 | 1069 | |||||||
B11BamHI-7 | B11_3_8 | T3 | AJ509931 | 535 | T7 | AJ509995 | 534 | 1069 | ||||||||||
B11BamHI-8 | B11_3_10 | T7 | AJ509926 | 535 | T3 | AJ509990 | 534 | 1069 | ||||||||||
B11BamHI-9 | B11_3_16 | T3 | AJ509927 | 535 | T7 | AJ509991 | 534 | 1069 | ||||||||||
B11BamHI-10 | B11_3_17 | T7 | AJ509928 | 535 | T3 | AJ509992 | 534 | 1069 | ||||||||||
Sum: | 10664 | |||||||||||||||||
B11 | B11HindIII-7 | BH_7 | T7 | AJ509932 | 337 | T3 | AJ509996 | 414 | 751 | |||||||||
B11HindIII-8 | BH_8 | T7 | AJ509933 | 504 | T3 | AJ509997 | 565 | 1069 | ||||||||||
B11HindIII-9 | BH_9 | T7 | AJ509934 | 504 | T3 | AJ509998 | 565 | 1069 | ||||||||||
B11HindIII-15 | BH_15 | T3 | AJ509935 | 504 | T7 | AJ509999 | 291 | 795 | ||||||||||
B11HindIII-17 | BH_17 | T7 | AJ509936 | 504 | T3 | AJ510000 | 565 | 1069 | ||||||||||
B11HindIII-18 | BH_18 | T7 | AJ509937 | 504 | T3 | AJ510001 | 565 | 1069 | ||||||||||
Sum: | 5822 | |||||||||||||||||
A7 | A7DraIII-1 | DraB_1 | T3 | AJ510002 | 609 | T7 | AJ510017 | 549 | 1158 | |||||||||
A7DraIII-2 | DraB_3 | T3 | AJ510003 | 609 | T7 | AJ510018 | 549 | 1158 | ||||||||||
A7DraIII-3 | DraB_4 | T3 | AJ510004 | 513 | T7 | AJ510019 | 549 | 1062 | ||||||||||
A7DraIII-4 | DraB_6 | T3 | AJ510005 | 609 | T7 | AJ510020 | 549 | 1158 | ||||||||||
A7DraIII-5 | DraB_8 | T3 | AJ510006 | 609 | T7 | AJ510021 | 549 | 1158 | ||||||||||
A7DraIII-6 | DraB_12 | T3 | AJ510007 | 609 | T7 | AJ510022 | 549 | 1158 | ||||||||||
A7DraIII-7 | DraB_14 | T3 | AJ510008 | 608 | T7 | AJ510023 | 549 | 1157 | ||||||||||
A7DraIII-8 | DraB_15 | T3 | AJ510009 | 393 | T7 | AJ510024 | 500 | 893 | ||||||||||
A7DraIII-9 | DraB_33 | T3 | AJ510010 | 609 | T7 | AJ510025 | 549 | 1158 | ||||||||||
A7DraIII-10 | DraB_37 | T3 | AJ510011 | 609 | T7 | AJ510026 | 549 | 1158 | ||||||||||
A7DraIII-11 | DraB_38 | T3 | AJ510012 | 609 | T7 | AJ510027 | 549 | 1158 | ||||||||||
A7DraIII-12 | DraB_40 | T3 | AJ510013 | 539 | T7 | AJ510028 | 549 | 1088 | ||||||||||
A7DraIII-13 | DraB_41 | T3 | AJ510014 | 609 | T7 | AJ510029 | 549 | 1158 | ||||||||||
A7DraIII-14 | DraB_43 | T3 | AJ510015 | 609 | T7 | AJ510030 | 549 | 1158 | ||||||||||
A7DraIII-15 | DraB_44 | T3 | AJ510016 | 609 | T7a | AJ510031 | 297 | T7 | 153 | 153 | 906 | |||||||
Sum: | 16686 | |||||||||||||||||
A7 | A7nonDraIII-1 | A7_oD_4 | T3 | AJ509891 | 535 | T7 | AJ509955 | 534 | 1069 | |||||||||
A7nonDraIII-2 | A7_oD_5 | T3 | AJ509892 | 535 | T7 | AJ509956 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7nonDraIII-3 | A7_oD_9 | T3 | AJ509893 | 535 | T7 | AJ509957 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7nonDraIII-4 | A7_oD_10 | T7 | AJ509894 | 535 | T3 | AJ509958 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7nonDraIII-5 | A7_oD_18 | T7 | AJ509895 | 535 | T3 | AJ509959 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7nonDraIII-6 | A7_oD_19 | T3 | AJ509896 | 535 | T7 | AJ509960 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7nonDraIII-7 | A7_oD_23 | T7 | AJ509897 | 535 | T3 | AJ509961 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7nonDraIII-8 | A7_oD_25 | T7 | AJ509898 | 535 | T3 | AJ509962 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7nonDraIII-9 | A7_oD_27 | T7 | AJ509899 | 535 | T3 | AJ509963 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7nonDraIII-10 | A7_oD_28 | T3 | AJ509900 | 535 | T7 | AJ509964 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7nonDraIII-11 | A7_oD_29 | T3 | AJ509901 | 535 | T7 | AJ509965 | 534 | 1069 | ||||||||||
A7nonDraIII-12 | A7_oD_33 | T3 | AJ509902 | 535 | T7 | AJ509966 | 534 | 1069 | ||||||||||
Sum: | 12828 | |||||||||||||||||
Individ 1 | Individ1-1 | SP6 | AJ509829 | 469 | T7 | AJ509829 | 489 | 469 | 489 | |||||||||
Individ1-2 | T7 | AJ509830 | 313 | SP6 | AJ509830 | 444 | 268 | 489 | ||||||||||
Individ1-3 | SP6 | AJ509831 | 416 | T7 | AJ509831 | 489 | 416 | 489 | ||||||||||
Individ1-4 | T7 | AJ509832 | 489 | SP6 | AJ509832 | 292 | 292 | 489 | ||||||||||
Individ1-5 | SP6 | AJ509833 | 472 | T7 | AJ509833 | 489 | 472 | 489 | ||||||||||
Individ1-6 | SP6 | AJ509834 | 271 | T7 | AJ509834 | 489 | 271 | 489 | ||||||||||
Individ1-7 | SP6 | AJ509835 | 248 | T7 | AJ509835 | 489 | 248 | 489 | ||||||||||
Individ1-9 | T7 | AJ509836 | 363 | SP6 | AJ509836 | 165 | 39 | 489 | ||||||||||
Individ1-10 | SP6 | AJ509837 | 416 | T7 | AJ509837 | 489 | 416 | 489 | ||||||||||
Individ 2 | Individ2-7 | SP6 | AJ509838 | 354 | T7 | AJ509838 | 400 | 265 | 489 | |||||||||
Individ2-8 | T7 | AJ509839 | 489 | SP6 | AJ509839 | 332 | 332 | 489 | ||||||||||
Individ 3 | Individ3-7 | T7 | AJ509840 | 489 | SP6 | AJ509840 | 489 | SP6a | 489 | 489 | 489 | |||||||
Individ 4 | Individ4-10 | T7 | AJ509841 | 363 | SP6 | AJ509841 | 283 | 157 | 489 | |||||||||
Sum: | 6846 | |||||||||||||||||
Gor 014 | Gor014-1 | T7 | AJ509815 | 271 | SP6 | AJ509815 | 329 | 78 | 522 | |||||||||
Gor014-3 | SP6 | AJ509822 | 396 | T7 | AJ509822 | 522 | 396 | 522 | ||||||||||
Gor014-4 | T7 | AJ509816 | 304 | SP6 | AJ509816 | 450 | 232 | 522 | ||||||||||
Gor014-6 | T7 | AJ509817 | 522 | SP6 | AJ509817 | 267 | 267 | 522 | ||||||||||
Gor014-7 | T7 | AJ509818 | 294 | SP6 | AJ509818 | 410 | 182 | 522 | ||||||||||
Gor014-8 | SP6 | AJ509819 | 173 | T7 | AJ509819 | 501 | 152 | 522 | ||||||||||
Gor 165 | Gor165-2 | SP6 | AJ509823 | 387 | T7 | AJ509823 | 293 | 158 | 522 | |||||||||
Gor165-4 | T7 | AJ509820 | 345 | SP6 | AJ509820 | 498 | 321 | 522 | ||||||||||
Gor165-7 | T7 | AJ509821 | 522 | SP6 | AJ509821 | 501 | 501 | 522 | ||||||||||
Double strand sequenced: | 6421 | 4698 | ||||||||||||||||
Total number of nucleotides analyzed: | 95817 | |||||||||||||||||
End sequences | ||||||||||||||||||
A6 | T7 | AJ509845 | 482 | SP6 | AJ509844 | 360 | 842 | |||||||||||
A7 | SP6 | AJ509846 | 461 | T7 | AJ509847 | 475 | 936 | |||||||||||
A8 | T7 | AJ509849 | 321 | SP6 | AJ509848 | 492 | 813 | |||||||||||
A10 | SP6 | AJ509850 | 482 | T7 | AJ509851 | 133 | 615 | |||||||||||
B11 | SP6 | AJ509842 | 339 | T7 | AJ509843 | 368 | 707 | |||||||||||
B11.60 | P86 | AJ509852 | 228 | 228 | ||||||||||||||
Clones left out | Identical to subclone | |||||||||||||||||
A6 | A6_2_21 | T3 | 535 | T7 | 534 | X-3A | 357 | 203 | 1069 | A6BamHI-3 | ||||||||
A6_2_23 | T3 | 477 | T7 | 534 | X-4A | 378 | 345 | 1011 | A6BamHI-4 | |||||||||
A7 | A7_7 | T7 | 535 | T3 | 534 | X-3A | 397 | 214 | 1069 | A7BamHI-1 | ||||||||
A8 | A8_9 | T7 | 535 | T3 | 534 | 1069 | A8BamHI-2 | |||||||||||
B11 | BH_1 | T7 | 453 | T3 | 397 | 850 | B11HindIII-8 | |||||||||||
BH_2 | T3 | 504 | T7 | 468 | 972 | B11HindIII-17 | ||||||||||||
BH_3 | T3 | 504 | T7 | 469 | 973 | B11HindIII-17 | ||||||||||||
BH_10 | T7 | 288 | 288 | left out due to low quality | ||||||||||||||
BH_11 | T3 | 504 | T7 | 565 | 1069 | B11BamHI-6 | ||||||||||||
BH_12 | T7 | 504 | T3 | 517 | 1021 | B11BamHI-6 | ||||||||||||
BH_14 | T3 | 504 | T7 | 565 | 1069 | B11BamHI-6 | ||||||||||||
BH_16 | T7 | 504 | T3 | 565 | 1069 | B11HindIII-9 | ||||||||||||
BH_19 | T7 | 248 | T3 | 468 | 716 | B11HindIII-17 | ||||||||||||
BH_21 | T3 | 447 | T7a | 333 | T7 | 191 | 191 | 780 | B11HindIII-17 | |||||||||
BH_22 | T7 | 252 | T3 | 536 | 788 | B11HindIII-9 | ||||||||||||
BH_23 | T7 | 504 | T3 | 565 | 1069 | B11HindIII-17 | ||||||||||||
BH_24 | T3 | 504 | T7 | 333 | 837 | B11BamHI-6 | ||||||||||||
A7-oD | A7_oD_11 | T7 | 535 | T3 | 534 | 1069 | A7nonDraIII-2 | |||||||||||
A7_oD_30 | T3 | 535 | T7 | 534 | 1069 | A7BamHI-9 | ||||||||||||
A7_oD_35 | T7 | 535 | T3 | 534 | 1069 | A7nonDraIII-9 | ||||||||||||
DraB | DraB_2 | T3 | 487 | T7 | 549 | 1036 | A7DraIII-1 | |||||||||||
DraB_11 | T3 | 397 | T7 | 549 | 946 | A7DraIII-10 | ||||||||||||
DraB_13 | T3 | 411 | T7 | 148 | 559 | left out due to low quality | ||||||||||||
DraB_16 | T3 | 374 | T7 | 549 | 923 | A7DraIII-3 | ||||||||||||
DraB_35 | T3 | 609 | T7 | 481 | 1090 | A7DraIII-7 | ||||||||||||
Gor 014 | Gor014-9 | T7 | 522 | SP6 | 508 | 508 | 522 | Gor014-7 | ||||||||||
Gor 165 | Gor165-1 | SP6 | 326 | 326 | unknown sequence | |||||||||||||
Gor165-3 | SP6 | 207 | 207 | unknown sequence | ||||||||||||||
Gor165-5 | T7 | 500 | SP6 | 166 | 144 | 522 | Gor014-7 | |||||||||||
Gor165-8 | SP6 | 105 | 105 | diverged alpha | ||||||||||||||
Gor165-9 | SP6 | 359 | 359 | diverged alpha | ||||||||||||||
Gor165-10 | T7 | 522 | 522 | diverged alpha | ||||||||||||||
Left out due to potential doublet cloning: | 23677 |
Letzte Aktualisierung 22.12.2002